PCR cuantitativa para la detección del virus de la tristeza de los cítricos en Colombia

1 recurso en línea (páginas 7-18).

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Main Authors:	Solano Luna, Luis Miguel, Chavarro Mesa, Edisson, Angel Díaz, Jorge Evelio
Format:	Artículo de revista
Language:	spa
Published:	Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia 2018
Subjects:	Frutas cítricas - Control integrado Cítricos - Cultivo Cítricos - Enfermedades y plagas Closterovirus tristeza del citrus Virosis (Plantas) Virus de la tristeza de los cítricos Agrosavia Closterovirus Cuantificación absoluta Detección de patógenos vegetales Enfermedades de los cítricos PCR en tiempo real SYBR Green
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Una pareja de iniciadores, diseñados a partir de secuencias conservadas en los marcos abiertos de lectura (ORF’s) 1b y 2, permitió amplificar el ARN genómico (ARNg), y un producto de 186 pb fue obtenido sin la presencia de dímeros o inespecificidad. El análisis de la curva de fusión mostró un pico entre 81 oC y 83 oC, con un coeficiente de correlación de 0,998 y una eficiencia de 99,1 %. La curva estándar se desarrolló a partir de una amplificación del producto de 186 pb y permitió realizar un análisis cuantitativo de las muestras, con un rango de detección de 1x108 hasta 1x103 copias de RNAg y con valores de coeficiente de variación bajos. La acumulación de CTV fue más alta en tejido foliar y en frutos que en corteza; entretanto, las diferencias demostradas entre varias especies de cítricos susceptibles a la infección fueron mínimas. Los resultados de este trabajo muestran que la mayor concentración de virus se encontró en el tercio superior de las plantas analizadas, seguida por el tercio bajo y, por último, el tercio medio. La qRT-PCR es un método específico y sensible de interés práctico en los procesos de detección de las enfermedades virales presentes en el cultivo de los cítricos y otros cultivos de interés comercial. Bibliografía: páginas 17-18. 2018-11-14T21:30:41Z 2018-11-14T21:30:41Z 2018-02-01 Artículo de revista http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Text https://purl.org/redcol/resource_type/ART http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 Solano Luna, L. M., Chavarro Mesa, E. & Angel Díaz, J. E. (2018). PCR cuantitativa para la detección del virus de la tristeza de los cítricos en Colombia. Ciencia y Agricultura, 15(1), 7-18. DOI: https://doi.org/10.19053/01228420.v15.n1.2018.7789. http://repositorio.uptc.edu.co/handle/001/2291 2539-0899 http://repositorio.uptc.edu.co/handle/001/2291 10.19053/01228420.v15.n1.2018.7789 spa Caicedo A., Muñoz O., Triviño A., Gómez JE. Bases para la certificación de plántulas de cítricos libres de enfermedades en Colombia. Novedades Técnicas. 2006; 7: 9-16. Morales J., Acosta O., Tamayo P., Peñaranda J. Characterization of Citrus tristeza virus isolates from Colombia. Rev. Protección Veg. 2013; 28(1): 45-53. Ruiz-Ruiz S., Moreno P., Guerri J., Ambros S. Discrimination between mild and severe Citrus tristeza virus isolates with a rapid and highly specific Real-Time Reverse Transcription-polymerase chain reaction method using TaqMan LNA probe. Phytopathology. 2009; 99: 307-315. DOI: http://doi.org/10.1094/ PHYTO-99-3-0307 Dawson WO., Bar-Joseph M., Garnsey SM., Moreno P. Citrus tristeza virus: Making an Ally from an Enemy. Annu. Rev. Phytopathol. 2015; 53: 137-55. 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